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预缴税款后跟进项票怎么抵扣？

根据《国家税务总局关于发布<纳税人跨县（市、区）提供建筑服务增值税征收管理暂行办法>的公告》(国家税务总局公告2016年第17号)的规定，纳税人应按照工程项目分别计算应预缴税款，分别预缴。

按照最近国家税务总局下发的《关于辅导期增值税一般纳税人增购增值税专用发票预缴增值税有关问题的通知》(国税函〔2005〕1097号)规定，纳税人在辅导期内增购专用发票，预缴的增值税可在本期增值税应纳税额中抵减。纳税人发生预缴税款抵减的，应自行计算需抵减的税款并向主管税务机关提出抵减申请。

如果仍有余额，主管税务机关应在纳税人辅导期结束后的第一个月内，一次性退还纳税人因增购专用发票发生的预缴增值税余额。

因此在次月申报时应自行计算需抵减的税款，并在申报表中列明，同时向税务机关提出抵减申请，即可抵减应纳税额。如果还有未抵减完的余额，可以在以后月份抵减应纳税额。

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